一是比对“一上”与“二上”预算。对比“一上”与“二上”预算主要是对预算真实性、合规性和准确性进行审核。如果“一上”比“二上”的项目多而且数额大，说明“一上”预算编制的随意性大，有多申报经费和项目的嫌疑；如果“一上”比“二上”预算基本一致，说明单位编制预算比较客观、真实。

　　二是比对预算与决算。通过预算与决算对比，主要是对预算编制、执行的合规性和准确性进行审核，可以发现预算单位是否严格按照批复的预算执行，有无人员经费、公用经费和项目经费相互挤占、虚列支出，收入预算是否全面完整等问题。

　　三是比对汇总预算与下属单位预算。通过总预算与分预算对比，可以发现预算单位是否按规定向所属预算单位批复预算，汇总预算后是否和汇总预算数一致，有无人为调整预算等问题。

　　四是将事业单位财务与企业财务比对。通过预算单位的事业单位财务与企业财务对比，关注事业单位收入是否转移给企业，企业是否为事业单位承担费用等问题。

　　五是比对基本账户与零余额账户。通过基本账户与零余额账户对比，关注是否存在违反零余额账户管理规定，虚列支出套取财政预算资金，将零余额账户资金转入自有资金账户用于其他支出，将专用存款账户资金和财政资金转为定期存款等问题。